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张锋发现靶向rna“新魔剪”,crispr家族再次壮大!时间:2017-02-23

      近日,发表在molecular cell杂志上题为“cas13b is a type vi-b crispr-associated rna-guided rnase differentially regulated by accessory proteins csx27 and csx28”的研究中,张锋带领的研究小组发现了两个新型的rna靶向crispr系统。这类新系统利用了一种新的cas酶——cas13b。

   研究发现,cas13b具有靶向和编辑rna的能力。仅靶向rna的这一能力使得研究人员能够以高通量地方式特异性地操纵rna,从而用于研究广泛的生物过程。

     broad研究所的报道称,为寻找crispr系统,张锋实验室采用计算机数据挖掘方法搜寻了不同微生物的基因组。不同于先前的生物信息学方法,张锋和他的研究小组致力于寻找缺乏cas1基因(与crispr免疫力相关的最常见的基因)的系统,以期找到新的crispr系统。

      这一新发现的酶与张锋研究组去年6月在science杂志上(论文:c2c2 is a single-component programmable rna-guided rna-targeting crispr effector)提出的cas13a(先前被称为c2c2,一种rna靶向酶)有一些共同的特性。

      broad研究所的报道称,为寻找crispr系统,张锋实验室采用计算机数据挖掘方法搜寻了不同微生物的基因组。不同于先前的生物信息学方法,张锋和他的研究小组致力于寻找缺乏cas1基因(与crispr免疫力相关的最常见的基因)的系统,以期找到新的crispr系统。


      这一新发现的酶与张锋研究组去年6月在science杂志上(论文:c2c2 is a single-component programmable rna-guided rna-targeting crispr effector)提出的cas13a(先前被称为c2c2,一种rna靶向酶)有一些共同的特性。


     像cas13a一样,cas13b仅需要单个向导rna就能找到靶标,并且从遗传学的角度是可编码的。此外,cas13b能够同时靶向多个rna转录本。但cas13b也有一些独特的特点,表明它与cas13a是不同的。这些特性使得cas13b更适用于微调基因功能。

      该研究的共同第一作者neena pyzocha说:“cas13b是一个最新的基因编辑工具。我们期望它能够在未来支持一些研究进展的产生。”


cell重要文章:一图详解2类crispr系统

      事实上,此次发现的crispr-cas13b属于2类vi-b型crispr系统。小编注意到,今年1月,张锋在cell杂志上发表了一篇题为“snapshot: class 2 crispr-cas systems”的snapshot,对2类crispr系统进行了详细的归纳(见文末图)。

      文章称,crispr-cas系统是在原核生物中发现的适应性免疫系统,基于不同的效应蛋白被分为两类。1类crispr-cas系统利用多个蛋白效应器复合物(multi-protein effector complexes),而2类crispr-cas系统利用单个蛋白效应器。基于不同的效应蛋白家族,2类crispr-cas系统被分为3种类型,9个亚型。第10个亚型还有待证明。

      文章具体介绍了不同亚型的2类crispr-cas系统的作用机制、起源与进化,以及应用方向。作者们认为,从概念上说,主要包括三个方面的应用:1)基因编辑,包括基因敲除、基因敲入以及引发突变;2)基因调控以及递送各种功能的部件(如转录因子)到dna中独特的位置;3)利用cas13(vi effector)靶向ssrna。




(本文转自生物谷)


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